22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0164 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  628  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  61.51 
 
 
304 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  57.56 
 
 
309 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  57.23 
 
 
309 aa  350  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  51.97 
 
 
306 aa  331  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  51.97 
 
 
306 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  51.97 
 
 
306 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  51.64 
 
 
306 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  49.39 
 
 
322 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  50.63 
 
 
329 aa  314  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  37.3 
 
 
312 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  36.66 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  35.67 
 
 
292 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  34.67 
 
 
292 aa  185  9e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  26.8 
 
 
305 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  23.55 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  29.9 
 
 
584 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  28.78 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  31.45 
 
 
707 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  31.3 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  29 
 
 
699 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  29.59 
 
 
704 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>