30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1159 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  97.76 
 
 		 312 aa  637    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  36.86 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  36.66 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  35.91 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  35.03 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  36.94 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  34.71 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  34.71 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  34.71 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  37.74 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  36.1 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  36.22 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  35.26 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  31.61 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  31.11 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  25.51 
 
 		 584 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  30.51 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  31.21 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  26.62 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.79 
 
 		 699 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.97 
 
 		 699 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  22.22 
 
 		 704 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  28.7 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  28.16 
 
 		 697 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  27.18 
 
 		 697 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  36.59 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  33.73 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0451  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.35 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>