38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2922 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 374 aa  767    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  76.37 
 
 		 426 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  51.9 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  50.28 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  50.28 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  50.68 
 
 		 361 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  52.5 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  48.91 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  49.03 
 
 		 356 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  48.19 
 
 		 353 aa  344  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  46.96 
 
 		 363 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  47.25 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  47.35 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  46.52 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  46.52 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  46.24 
 
 		 356 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  46.3 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  46.22 
 
 		 363 aa  328  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  46.26 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  44.66 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  46.41 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  47.49 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  44.72 
 
 		 355 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  42.63 
 
 		 375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  43.4 
 
 		 378 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  42.5 
 
 		 281 aa  232  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  39.72 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  36.97 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  36.26 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  43.14 
 
 		 245 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  30.67 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  33.8 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  29.74 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  55.84 
 
 		 85 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  28.24 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  30.2 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  25.27 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  26.85 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>