46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0515 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  100 
 
 
360 aa  739    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  58.06 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  36.73 
 
 
380 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  37.07 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  33.49 
 
 
382 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  34.24 
 
 
355 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  33.9 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  33.52 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  35 
 
 
362 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  30.21 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  38.79 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  39.84 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  34.97 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  30.7 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  34.46 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  30.48 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  28.8 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  26.69 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  36.92 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  35 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  35.71 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  28.24 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  35.48 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  30.39 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  42.34 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  34.84 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  36.09 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  31.39 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  28.12 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  29.25 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  33.11 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  35.79 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  27.35 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2914  hypothetical protein  25.79 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2724  hypothetical protein  27.59 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.93 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  48 
 
 
85 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  24.48 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1012  hypothetical protein  33.77 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840364  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32 
 
 
995 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  31.43 
 
 
692 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2199  negative regulator of replication initiation  28.44 
 
 
174 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0698  hypothetical protein  29.17 
 
 
248 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>