94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0411 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  100 
 
 		 374 aa  763    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  41.15 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  39.75 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  39.86 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  36.81 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  35.12 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.33 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  34.52 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  41.04 
 
 		 454 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.93 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  33.33 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  34.34 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32.93 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  32.34 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  27.65 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  36.59 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  34.55 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  33.73 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  31.37 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  34.21 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  32.35 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1768  hypothetical protein  28.44 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.530857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  32.08 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  38.22 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  29.94 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  36.08 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  38.22 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  29.94 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  29.94 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  39.04 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  39.02 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.25 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.92 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.49 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  34.87 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  34.04 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  35.53 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  31.88 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  25 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  32.81 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  30.25 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  32.68 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  30.07 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  24.36 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.08 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  30.68 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.43 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.13 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  32.26 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  32.26 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.6 
 
 		 125 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  30.93 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  30.7 
 
 		 128 aa  53.9  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  27.37 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  35.2 
 
 		 154 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  35.2 
 
 		 154 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  27.06 
 
 		 184 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  28.47 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  32.2 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  35.2 
 
 		 154 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0142  MutT family phosphoesterase  31.34 
 
 		 562 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  38.46 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  29.93 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  26.98 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  29.93 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 585 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.04 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.61 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  29.69 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2313  hypothetical protein  30.95 
 
 		 624 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2605  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.22 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2225  hypothetical protein  30.95 
 
 		 624 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00433627  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.22 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  28.08 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  34.12 
 
 		 669 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  36.08 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  27.54 
 
 		 351 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  37.5 
 
 		 1131 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  30.39 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  30.18 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1635  hypothetical protein  31.25 
 
 		 643 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  36.13 
 
 		 208 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.975729  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  28.07 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>