84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3544 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  100 
 
 		 305 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  63.73 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  50 
 
 		 305 aa  329  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  52.27 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  52.79 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  47.59 
 
 		 310 aa  322  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  47.59 
 
 		 310 aa  321  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  53.44 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  50.65 
 
 		 302 aa  318  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  47.23 
 
 		 302 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  49.34 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  47.56 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  50.51 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  46.13 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  44.69 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  41.1 
 
 		 304 aa  248  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  45.42 
 
 		 306 aa  247  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  40.86 
 
 		 302 aa  241  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  45.28 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  45.28 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  41.99 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  42.02 
 
 		 306 aa  225  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  40.2 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  39.74 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  40.45 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  40.45 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  38.64 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  36.6 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  34.63 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  38.19 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  47.79 
 
 		 128 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  28.86 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  31.54 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  27.51 
 
 		 286 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.3 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  24.49 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  27.04 
 
 		 454 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  25.17 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  27.69 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  27.42 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.34 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  33.55 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  34.72 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  26.53 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.33 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.33 
 
 		 154 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.33 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.94 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  31.11 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 493 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  24.81 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  29.92 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  29.77 
 
 		 447 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  33.93 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  30.49 
 
 		 333 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  36.76 
 
 		 421 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  36.14 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  36.14 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.35 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  33.05 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  28.57 
 
 		 609 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  32.98 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  31.4 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 585 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  28.57 
 
 		 609 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  31.4 
 
 		 182 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  29.91 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.82 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  31.34 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  26.71 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  27.07 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  34.38 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  38.46 
 
 		 70 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  31.03 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3051  hypothetical protein  31 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  27.69 
 
 		 450 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  32.48 
 
 		 222 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>