136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0993 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 421 aa  842    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  39.83 
 
 		 207 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  35.9 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  38.98 
 
 		 285 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  37.82 
 
 		 230 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  41.46 
 
 		 310 aa  86.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  39.5 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.13 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  37.21 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  40.77 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  37.29 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  34.27 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  36.8 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  32.84 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  38.4 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.07 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  34.13 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.51 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  38.89 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  34.23 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  33.94 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  36.7 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  36 
 
 		 296 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  36.75 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  37.04 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.04 
 
 		 125 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  34.75 
 
 		 272 aa  67  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  37.27 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  33.04 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  35.04 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  33.63 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  33.04 
 
 		 154 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  35.34 
 
 		 306 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  35.25 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  33.04 
 
 		 154 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  39.66 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.93 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  33.93 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  39.02 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  33.04 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  33.04 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  30 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  37.84 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  30.77 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  34.75 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  28.91 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  37.17 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  34.75 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  30.63 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  30.77 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.91 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  36.04 
 
 		 799 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  36.04 
 
 		 799 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  31.9 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  35.96 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  35.58 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  32.48 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  35.9 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  26.77 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  40.58 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  28 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  43.64 
 
 		 1131 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  37.89 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  32.33 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  34.4 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  32.56 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  31.19 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30.63 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  31.19 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  25.98 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  26.77 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 304 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  37.68 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  37.68 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  37.68 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  28.71 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  28.46 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  37.89 
 
 		 189 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  41.18 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  25.2 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  44.16 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  44.16 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  35.04 
 
 		 288 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  35.2 
 
 		 349 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  29.7 
 
 		 145 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  34.15 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  32.37 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  30.91 
 
 		 193 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  34.45 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  27.59 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  36.76 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  25.4 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>