144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0010 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  100 
 
 		 271 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  40.39 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  38.7 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  39.38 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  37.19 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  38.75 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  40.34 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  37.25 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  37.01 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  42.86 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  39.16 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  39.34 
 
 		 348 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  32.95 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.33 
 
 		 440 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.89 
 
 		 327 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  30.65 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  33.18 
 
 		 317 aa  99  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.51 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.51 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  25.79 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  38.41 
 
 		 585 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.27 
 
 		 421 aa  82  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  31.75 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  30.85 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3538  hypothetical protein  28.73 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0084  restriction endonuclease  28.06 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  34.59 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.46 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  28.46 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  48.57 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  32.81 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.46 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  36.13 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  28.57 
 
 		 125 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  33.12 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  47.54 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  32.81 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  34.71 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  30.53 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  62.16 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  35.87 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30.77 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  54.35 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  59.46 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  64.86 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  29.93 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.93 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  61.54 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  34.69 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2804  restriction endonuclease  26.52 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  31.71 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  44.83 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  48.98 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3481  restriction endonuclease  25.97 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  30.29 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 374 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.94 
 
 		 799 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.94 
 
 		 799 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  32.86 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  32.86 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  36 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  29.77 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  30.53 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.46 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  29.77 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  53.85 
 
 		 338 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  29.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  47.5 
 
 		 329 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0356  hypothetical protein  36.51 
 
 		 161 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000881687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  39.58 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1845  restriction endonuclease  24.23 
 
 		 190 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  25.89 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  34.26 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  54.05 
 
 		 739 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  31.43 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  33.87 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  37.78 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  33.68 
 
 		 338 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  26.92 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  41.67 
 
 		 730 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.45 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 493 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  30.19 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  29.85 
 
 		 520 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  36.62 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  36.62 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  36.62 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  30.58 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2544  hypothetical protein  29.53 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.111302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  42.55 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  27.56 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  26.83 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>