49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4795 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  80 
 
 
178 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  64.13 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  64.13 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  61.54 
 
 
233 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  32.16 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  35.11 
 
 
171 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  31.76 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  37.74 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  38.41 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  40.98 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  43.16 
 
 
520 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  38.68 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  34.86 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  34.29 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  39.55 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  39.53 
 
 
260 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  27.78 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  41.09 
 
 
260 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.63 
 
 
421 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  41.28 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  41.18 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  35.71 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  37.76 
 
 
250 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  31 
 
 
313 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  35.34 
 
 
285 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.82 
 
 
359 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.52 
 
 
305 aa  51.6  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.71 
 
 
271 aa  51.2  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.73 
 
 
349 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  28.21 
 
 
368 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  34.82 
 
 
453 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  22.29 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.63 
 
 
287 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  33.33 
 
 
345 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  32.46 
 
 
289 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  25.93 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  32.33 
 
 
281 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  27.08 
 
 
144 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  32.61 
 
 
310 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  21.77 
 
 
440 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  32.33 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  21.77 
 
 
327 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.95 
 
 
262 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0623  hypothetical protein  25 
 
 
385 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.907452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  28.86 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  33.04 
 
 
455 aa  41.6  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  29.31 
 
 
317 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>