75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2745 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  100 
 
 		 222 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  42.68 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  46.92 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  42.62 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  36.51 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  34.58 
 
 		 359 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  36.51 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.83 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  39.45 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  35.61 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.31 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  38.05 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  38.05 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  38.05 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  29.82 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  30.28 
 
 		 799 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  30.28 
 
 		 799 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  30.58 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  33.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 299 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  23.68 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  23.18 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  31.45 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2142  restriction endonuclease  31.62 
 
 		 547 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  45.71 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  45.71 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  28.8 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  45.71 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28.57 
 
 		 421 aa  48.5  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  32.22 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 520 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  30.3 
 
 		 447 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  32.71 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  28.46 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  39.53 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  36.79 
 
 		 281 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  42.86 
 
 		 311 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.7 
 
 		 303 aa  45.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3506  restriction endonuclease  29.23 
 
 		 288 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  30.71 
 
 		 355 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27 
 
 		 262 aa  45.1  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  28.43 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  30.6 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  42.86 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.47 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  28.84 
 
 		 454 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 450 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  36.11 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  27.45 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  40.68 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  27.35 
 
 		 384 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  32.91 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  26.55 
 
 		 305 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 310 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  26.4 
 
 		 302 aa  42.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  31.53 
 
 		 493 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  30.3 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  30.3 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  30.25 
 
 		 348 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  32.48 
 
 		 305 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  29.06 
 
 		 330 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  29.06 
 
 		 271 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  36.17 
 
 		 345 aa  41.6  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  33.71 
 
 		 323 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  33.71 
 
 		 323 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>