73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1692 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  58.55 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  56.77 
 
 		 310 aa  361  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  58.42 
 
 		 302 aa  360  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  56.77 
 
 		 310 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  56.63 
 
 		 305 aa  352  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  55.26 
 
 		 304 aa  348  5e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  53.44 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  52.15 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  52.46 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  52.77 
 
 		 306 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  51.63 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  51 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  47.74 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  42.43 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  43.56 
 
 		 302 aa  245  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  42.12 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  41.31 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  44.59 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  45.28 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  45.28 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  38.44 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  40.76 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  39.61 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  37.25 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  37.58 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  36.01 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  36.01 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  36.01 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  37.01 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  28.9 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  46.9 
 
 		 128 aa  98.2  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  27.84 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.1 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  25.41 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  29.35 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  25.19 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  26.51 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  26.51 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  35.11 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  26.44 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  26.14 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.75 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.75 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  28.75 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  32.11 
 
 		 609 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  32.11 
 
 		 609 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  28.76 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.65 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  23.99 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  26.72 
 
 		 493 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.25 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.04 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  26.39 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  35.14 
 
 		 447 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  24.56 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  29.31 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  27.86 
 
 		 493 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.7 
 
 		 222 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.36 
 
 		 345 aa  45.8  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.33 
 
 		 440 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  31.62 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  43.06 
 
 		 70 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.92 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  27.78 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>