67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1078 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  100 
 
 		 333 aa  676    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  46.71 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  43.98 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  41.39 
 
 		 342 aa  246  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  46.35 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  37.05 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  30.47 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  27.38 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.84 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  28.05 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  39.11 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  28.28 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  28.61 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  35.36 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  26.18 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  26.96 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  28.52 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  36.67 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  29.21 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  35.4 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  30.94 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  36.43 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  36.59 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  30 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  33.66 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.43 
 
 		 732 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  30 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.64 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.72 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  27.2 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  26.4 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.15 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  32.2 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  28.11 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  28.11 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  27.08 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  30.49 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  28.87 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.06 
 
 		 723 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  28.06 
 
 		 154 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.06 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.71 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.06 
 
 		 154 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  27.17 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.82 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  30.25 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  30.47 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  30.47 
 
 		 853 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  28.57 
 
 		 125 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  27.34 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  26.92 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  31.36 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  31.06 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0822  restriction endonuclease  27.17 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  32.84 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  28.1 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  25.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  24.68 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  27.37 
 
 		 384 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>