71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0422 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  60.98 
 
 		 296 aa  152  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  47.15 
 
 		 305 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  49.17 
 
 		 305 aa  116  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  48.03 
 
 		 302 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  47.79 
 
 		 305 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  49.58 
 
 		 302 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  51.72 
 
 		 306 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  44.55 
 
 		 310 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  51.28 
 
 		 310 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  51.35 
 
 		 293 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  46.51 
 
 		 312 aa  107  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  51.28 
 
 		 310 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  49.55 
 
 		 304 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  47.86 
 
 		 302 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  45.13 
 
 		 304 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  45.69 
 
 		 306 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  50 
 
 		 303 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  44.09 
 
 		 304 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  43.33 
 
 		 307 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  49.57 
 
 		 305 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  47.22 
 
 		 311 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  49.11 
 
 		 297 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  46.9 
 
 		 303 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  44.76 
 
 		 304 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  44.76 
 
 		 304 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  44.76 
 
 		 304 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  43.1 
 
 		 306 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  44.55 
 
 		 304 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  39.6 
 
 		 305 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  39.6 
 
 		 305 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  41.07 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  33.66 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  35.24 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  35.96 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.7 
 
 		 374 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  25.98 
 
 		 493 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 328 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  41.56 
 
 		 325 aa  52  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 454 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 300 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 349 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  34.83 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.89 
 
 		 230 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.09 
 
 		 291 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1903  restriction endonuclease  33 
 
 		 640 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  hitchhiker  0.0000000420934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  35.42 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 286 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  36.96 
 
 		 440 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  27.73 
 
 		 349 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 291 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.87 
 
 		 585 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  26.61 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  31.76 
 
 		 355 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  36.96 
 
 		 327 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  29.47 
 
 		 345 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  25.26 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  31 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  33 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  33 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  36.49 
 
 		 421 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  31 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  30.56 
 
 		 1148 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0213  hypothetical protein  29.47 
 
 		 84 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>