94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1958 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  100 
 
 		 312 aa  634    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  45.81 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  43.49 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  44.69 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  44.69 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  42.77 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  44.41 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  43 
 
 		 302 aa  242  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  43.73 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  42.12 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  40.58 
 
 		 310 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  40.26 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  43.37 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  40.84 
 
 		 297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  39.87 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  39.16 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  38.56 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  38.59 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  39.23 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  41.1 
 
 		 306 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  35.92 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  36.6 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  36.98 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  36.98 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  36.74 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  36.66 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  36.66 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  36.66 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  35.03 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  34.59 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  31.61 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  46.51 
 
 		 128 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  26.47 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  26.47 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  28.62 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  27.19 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  26.37 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  26.95 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  24.84 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.6 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  28.14 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  38.98 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  38.98 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  38.98 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  38.98 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  30.92 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  28.02 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  28.49 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  31.52 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28.91 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  31.08 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  28.48 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  34.92 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.36 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  27.2 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  27.52 
 
 		 609 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  27.52 
 
 		 609 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  32 
 
 		 450 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.26 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  31.54 
 
 		 200 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2800  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30.95 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  35.59 
 
 		 193 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.22 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 799 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  32.2 
 
 		 182 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 799 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  27.43 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  24.18 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 498 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.13 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.6 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  32.2 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  28.85 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  27.64 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  26.5 
 
 		 585 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.91 
 
 		 454 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  29.27 
 
 		 196 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  27.68 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 219 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  29.6 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  33.33 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  28.17 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  32.86 
 
 		 454 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 262 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>