115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2286 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  100 
 
 
359 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  46.74 
 
 
368 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  48.3 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  51.75 
 
 
510 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  64.79 
 
 
509 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  45.78 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  33.64 
 
 
520 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  49.37 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  43.37 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  34.59 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  40.82 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  40.7 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  34 
 
 
169 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.35 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  34.58 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  47.73 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  39.66 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.96 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  39.76 
 
 
260 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  39.76 
 
 
260 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  37.98 
 
 
255 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  37.4 
 
 
291 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  28.68 
 
 
171 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  37.4 
 
 
291 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  45.45 
 
 
208 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  41.76 
 
 
270 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  30.56 
 
 
182 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  31.86 
 
 
145 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  29.17 
 
 
182 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  40 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  33.64 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  37.78 
 
 
288 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  38.89 
 
 
249 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  25.41 
 
 
250 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  35.07 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  36.45 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  38.96 
 
 
413 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  31.48 
 
 
178 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  37.35 
 
 
260 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  32.65 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  32.65 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  32.65 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  36.54 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.85 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.33 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  33.82 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  32.41 
 
 
154 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30.43 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  31.03 
 
 
189 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  32.41 
 
 
154 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.57 
 
 
289 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  33.64 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  31.82 
 
 
197 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  31.58 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  37 
 
 
297 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  32.41 
 
 
154 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  28.79 
 
 
287 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  33.66 
 
 
493 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  26.63 
 
 
207 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  36.84 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  34.19 
 
 
125 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  37 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  32.26 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  33.93 
 
 
293 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  35.94 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  35.92 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  35.64 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  36.84 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  35.04 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  38.04 
 
 
498 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  37.8 
 
 
383 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  26.15 
 
 
184 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  27.68 
 
 
556 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  37.25 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  33 
 
 
450 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  34.53 
 
 
585 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  28.32 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  29.7 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  34.65 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  32.14 
 
 
252 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  33.88 
 
 
147 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  34.65 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  33.04 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.58 
 
 
296 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  27.91 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  30.86 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  27.14 
 
 
230 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  27.5 
 
 
317 aa  46.2  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  30.21 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  36.26 
 
 
196 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  36.56 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  32.71 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  37.04 
 
 
799 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  26.49 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  37.04 
 
 
799 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.83 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  33.96 
 
 
215 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  36.11 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  32.71 
 
 
200 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>