50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4155 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  83.74 
 
 		 249 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  60.82 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  60.41 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  61.11 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  57.02 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  43.27 
 
 		 145 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  53.12 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  40.38 
 
 		 289 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  39.32 
 
 		 171 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  44.79 
 
 		 520 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  37.27 
 
 		 182 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  36.36 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  37.84 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  39.84 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  38.61 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  45.78 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  39.22 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  44.55 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  39.64 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  41.51 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  39.64 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  39.64 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.82 
 
 		 349 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  34.02 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  34.58 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28.95 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  40.24 
 
 		 368 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  37.65 
 
 		 346 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 152 aa  49.7  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  32.69 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  33.06 
 
 		 1291 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.44 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 493 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  33.04 
 
 		 1248 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 345 aa  45.4  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  38.46 
 
 		 558 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.98 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  34.57 
 
 		 556 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.82 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  23.97 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  25 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30.48 
 
 		 317 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>