More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1010 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  40.89 
 
 		 1082 aa  750    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  100 
 
 		 1248 aa  2570    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  38.76 
 
 		 1291 aa  783    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  41.43 
 
 		 1080 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  39.11 
 
 		 1075 aa  727    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  47.18 
 
 		 1259 aa  1054    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  39.01 
 
 		 1131 aa  339  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  34.67 
 
 		 1148 aa  315  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.1 
 
 		 1010 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  32.62 
 
 		 1149 aa  312  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1146 aa  304  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  34.9 
 
 		 918 aa  265  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  35.11 
 
 		 918 aa  265  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  35.11 
 
 		 918 aa  265  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  35.11 
 
 		 918 aa  265  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  35.11 
 
 		 918 aa  265  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  34.91 
 
 		 918 aa  263  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  34.91 
 
 		 918 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 		 918 aa  263  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 		 918 aa  263  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  34.58 
 
 		 918 aa  263  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  34.38 
 
 		 918 aa  260  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1128 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 892 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 		 898 aa  255  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  34.6 
 
 		 777 aa  252  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1028 aa  251  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 		 1033 aa  251  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  36 
 
 		 621 aa  250  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  34.71 
 
 		 1065 aa  245  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  35.13 
 
 		 902 aa  245  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 		 925 aa  244  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  34.38 
 
 		 1072 aa  243  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  35.07 
 
 		 901 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  35.65 
 
 		 1019 aa  242  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  32.59 
 
 		 924 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  34.42 
 
 		 1194 aa  239  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 933 aa  239  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  35.73 
 
 		 990 aa  238  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.95 
 
 		 1067 aa  237  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  33.59 
 
 		 1185 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 1152 aa  236  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 		 617 aa  234  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.33 
 
 		 1099 aa  234  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  34.97 
 
 		 1063 aa  233  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  34.99 
 
 		 899 aa  231  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 1021 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  34.65 
 
 		 917 aa  230  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 		 1112 aa  230  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 1104 aa  229  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  31.38 
 
 		 1068 aa  229  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  33.98 
 
 		 1078 aa  229  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  35.28 
 
 		 1050 aa  228  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 1091 aa  228  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 		 1029 aa  228  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  34.81 
 
 		 903 aa  228  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.86 
 
 		 1091 aa  228  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.9 
 
 		 1068 aa  228  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  32.96 
 
 		 1033 aa  228  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  32.48 
 
 		 1175 aa  227  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  33.27 
 
 		 1019 aa  227  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.32 
 
 		 1080 aa  227  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  33.78 
 
 		 1100 aa  226  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  33.2 
 
 		 1006 aa  226  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  32.81 
 
 		 1048 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  33.62 
 
 		 1531 aa  226  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  33.99 
 
 		 1088 aa  225  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  33.14 
 
 		 1386 aa  224  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 		 1007 aa  224  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 1112 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 1155 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 1074 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 1048 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  32.09 
 
 		 1150 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.2 
 
 		 914 aa  222  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 876 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  33.48 
 
 		 1087 aa  222  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 1068 aa  222  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  33.14 
 
 		 872 aa  221  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  33.2 
 
 		 1013 aa  220  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 		 922 aa  220  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 1007 aa  220  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 633 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  30.9 
 
 		 1250 aa  218  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  34.15 
 
 		 949 aa  218  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  33.99 
 
 		 896 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  33.07 
 
 		 1113 aa  218  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  34.89 
 
 		 1082 aa  218  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.07 
 
 		 1113 aa  218  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 		 641 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.42 
 
 		 918 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  32.87 
 
 		 1362 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 1047 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  34.06 
 
 		 1040 aa  217  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  32 
 
 		 988 aa  217  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  33.4 
 
 		 1047 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  32.89 
 
 		 958 aa  217  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 1108 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  31.81 
 
 		 886 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 1069 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>