More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3307 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1033 aa  2053    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  31.2 
 
 
1128 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  32.37 
 
 
1131 aa  370  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  31.04 
 
 
1080 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  34.8 
 
 
1248 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  31.17 
 
 
1075 aa  254  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  26.29 
 
 
1148 aa  244  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  32.76 
 
 
918 aa  244  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  32.76 
 
 
918 aa  243  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  32.76 
 
 
918 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  32.76 
 
 
918 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  32.76 
 
 
918 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  32.76 
 
 
918 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
1082 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  29.93 
 
 
1146 aa  241  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  32.57 
 
 
918 aa  241  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 
918 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  32 
 
 
918 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  32.19 
 
 
918 aa  238  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  30.09 
 
 
1291 aa  236  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  31.03 
 
 
1149 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  29.17 
 
 
1259 aa  229  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
1021 aa  229  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
918 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.64 
 
 
1010 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
1055 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  32.87 
 
 
886 aa  220  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
933 aa  220  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  32.63 
 
 
1354 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  33.33 
 
 
621 aa  218  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  34.22 
 
 
990 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  31.11 
 
 
1006 aa  208  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  29.12 
 
 
1048 aa  208  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  33.67 
 
 
901 aa  208  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  32.72 
 
 
949 aa  208  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  33.8 
 
 
903 aa  208  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 
898 aa  207  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  34.57 
 
 
1065 aa  207  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  30.73 
 
 
924 aa  206  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  29.18 
 
 
1185 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 
641 aa  205  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  29.26 
 
 
980 aa  205  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
1112 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
1047 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  30.97 
 
 
1084 aa  204  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  30.57 
 
 
1084 aa  204  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.38 
 
 
1099 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
617 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  31.41 
 
 
1047 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  32.46 
 
 
1531 aa  203  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  29.94 
 
 
1087 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  31.15 
 
 
1019 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 
1007 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  29.32 
 
 
1175 aa  202  3.9999999999999996e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
925 aa  202  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
1068 aa  202  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.73 
 
 
1026 aa  201  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  31.82 
 
 
902 aa  201  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
892 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.48 
 
 
1194 aa  200  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.05 
 
 
1078 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
1050 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 
1028 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.89 
 
 
1072 aa  199  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.64 
 
 
1068 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  32.56 
 
 
917 aa  199  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  34.62 
 
 
1013 aa  198  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
1068 aa  198  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 
895 aa  198  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  35.25 
 
 
1063 aa  198  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  34.47 
 
 
899 aa  197  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
931 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
1091 aa  197  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 
633 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  30.77 
 
 
1007 aa  197  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
1164 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  32.57 
 
 
1437 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  32.13 
 
 
1086 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
1069 aa  195  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 
1152 aa  195  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  31.13 
 
 
1362 aa  195  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.14 
 
 
1069 aa  194  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  29.14 
 
 
1069 aa  194  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  32.19 
 
 
1033 aa  194  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 
1074 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.8 
 
 
977 aa  193  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  31.45 
 
 
1071 aa  193  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  32.06 
 
 
1164 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
1048 aa  192  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  32.55 
 
 
1142 aa  191  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.95 
 
 
1068 aa  191  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  31.37 
 
 
1040 aa  191  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.37 
 
 
1067 aa  191  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
1104 aa  190  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  30.8 
 
 
1386 aa  190  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  32.82 
 
 
1357 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
1139 aa  188  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  32.41 
 
 
1062 aa  188  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 
1082 aa  187  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
1261 aa  187  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>