More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2939 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  100 
 
 		 1131 aa  2311    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1128 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.25 
 
 		 1033 aa  355  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  39.01 
 
 		 1248 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1146 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  27.46 
 
 		 1148 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  27.15 
 
 		 1149 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  34.8 
 
 		 1259 aa  306  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  34.6 
 
 		 1075 aa  302  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  33.67 
 
 		 1291 aa  295  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.8 
 
 		 1010 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 1082 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  35.33 
 
 		 1080 aa  281  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  36.89 
 
 		 1006 aa  261  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  35.66 
 
 		 621 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  35.76 
 
 		 1048 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  35.33 
 
 		 1007 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  34.01 
 
 		 1072 aa  238  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 		 1007 aa  237  9e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 		 892 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 		 918 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 1047 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  34.55 
 
 		 1047 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  33.4 
 
 		 918 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  33.4 
 
 		 918 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 		 617 aa  234  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  33.4 
 
 		 918 aa  234  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  33.4 
 
 		 918 aa  234  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  32.93 
 
 		 918 aa  234  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  33.4 
 
 		 918 aa  234  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  33.4 
 
 		 918 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  33.4 
 
 		 918 aa  234  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 		 1028 aa  234  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  33.33 
 
 		 918 aa  234  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 1152 aa  231  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 		 1048 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  37.27 
 
 		 924 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 918 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  36.27 
 
 		 1019 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  36.51 
 
 		 899 aa  231  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.6 
 
 		 1099 aa  231  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.86 
 
 		 1087 aa  230  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  35.95 
 
 		 1063 aa  230  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 		 925 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  35.06 
 
 		 1065 aa  228  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  32.65 
 
 		 1194 aa  226  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.34 
 
 		 977 aa  225  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  33.47 
 
 		 1069 aa  224  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  33.47 
 
 		 1069 aa  224  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 1112 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 933 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  35.43 
 
 		 1019 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  34.86 
 
 		 886 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 		 895 aa  222  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 		 1082 aa  222  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  34 
 
 		 1078 aa  221  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 		 1164 aa  220  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  32.14 
 
 		 1084 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  34.7 
 
 		 917 aa  219  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 		 1074 aa  218  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  30.99 
 
 		 1175 aa  218  5.9999999999999996e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 		 641 aa  218  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  34.87 
 
 		 1040 aa  217  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  34.18 
 
 		 1185 aa  217  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 1050 aa  217  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 1112 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  33.89 
 
 		 902 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  32.25 
 
 		 1531 aa  217  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.75 
 
 		 1084 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  34.68 
 
 		 1033 aa  215  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  35.03 
 
 		 990 aa  214  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 1139 aa  214  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  35.64 
 
 		 901 aa  214  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  31.36 
 
 		 980 aa  214  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  33.26 
 
 		 1362 aa  212  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.92 
 
 		 1029 aa  212  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.06 
 
 		 1026 aa  212  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.54 
 
 		 1067 aa  211  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  29.72 
 
 		 1125 aa  211  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 1055 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  32.72 
 
 		 949 aa  210  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  34.44 
 
 		 958 aa  209  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 982 aa  209  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  33.78 
 
 		 1071 aa  208  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  32.98 
 
 		 1386 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  32.88 
 
 		 777 aa  207  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 898 aa  207  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  31.3 
 
 		 1077 aa  207  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  33.67 
 
 		 988 aa  206  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 		 1069 aa  206  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 1403 aa  205  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  31.85 
 
 		 1088 aa  205  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 1068 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.58 
 
 		 1068 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  36.18 
 
 		 903 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 		 1021 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  33.33 
 
 		 1013 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  34.44 
 
 		 991 aa  202  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 1068 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>