More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4585 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  38.76 
 
 		 1248 aa  786    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  100 
 
 		 1291 aa  2645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  37.99 
 
 		 1259 aa  758    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  37.38 
 
 		 1080 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  36.2 
 
 		 1075 aa  628  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 		 1082 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  34.33 
 
 		 1148 aa  326  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  32.52 
 
 		 1149 aa  311  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1146 aa  310  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  33.67 
 
 		 1131 aa  295  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.01 
 
 		 1010 aa  268  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1128 aa  266  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 918 aa  248  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  34.54 
 
 		 902 aa  248  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  34.57 
 
 		 1006 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 		 898 aa  243  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 918 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  30.66 
 
 		 918 aa  241  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  35.52 
 
 		 892 aa  240  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  32.22 
 
 		 918 aa  239  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  32.22 
 
 		 918 aa  239  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  30.83 
 
 		 918 aa  239  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  35.07 
 
 		 899 aa  239  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  32.22 
 
 		 918 aa  239  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  32.41 
 
 		 918 aa  239  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  32.41 
 
 		 918 aa  238  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  32.04 
 
 		 918 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  32.04 
 
 		 918 aa  236  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  33.51 
 
 		 901 aa  234  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  34.9 
 
 		 1007 aa  233  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1152 aa  228  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 1104 aa  228  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  34.31 
 
 		 1033 aa  227  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  32.96 
 
 		 1185 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 1028 aa  225  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 		 876 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  33.01 
 
 		 958 aa  223  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 		 1033 aa  224  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 		 1007 aa  224  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 		 1074 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  34.37 
 
 		 872 aa  221  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  31.96 
 
 		 1071 aa  219  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 		 1029 aa  219  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  32 
 
 		 924 aa  219  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 		 1050 aa  218  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 		 933 aa  217  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  31.46 
 
 		 1113 aa  217  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 1113 aa  217  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 1112 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 925 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  32.49 
 
 		 917 aa  216  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  33.66 
 
 		 777 aa  216  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.65 
 
 		 1026 aa  215  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 		 1047 aa  215  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  33.65 
 
 		 621 aa  215  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 		 1068 aa  214  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  33.27 
 
 		 1019 aa  214  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  33.2 
 
 		 1047 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  32.24 
 
 		 949 aa  214  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1070 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  33.92 
 
 		 990 aa  213  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  33.66 
 
 		 1040 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  32.62 
 
 		 988 aa  212  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  31.08 
 
 		 1194 aa  212  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.91 
 
 		 1067 aa  212  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.89 
 
 		 1068 aa  212  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  32.88 
 
 		 886 aa  211  9e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  35.08 
 
 		 617 aa  210  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.88 
 
 		 914 aa  211  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  32.46 
 
 		 1091 aa  210  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 1073 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  32.51 
 
 		 773 aa  211  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  31.04 
 
 		 1175 aa  209  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.88 
 
 		 918 aa  210  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  31.08 
 
 		 1068 aa  209  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 895 aa  208  5e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  32.35 
 
 		 1086 aa  208  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 1073 aa  208  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 1110 aa  208  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 1112 aa  207  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 		 1403 aa  207  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  32.51 
 
 		 663 aa  207  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 1073 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 1091 aa  207  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.88 
 
 		 666 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 1108 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 		 1048 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  32.43 
 
 		 1088 aa  206  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  33.27 
 
 		 1082 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 1073 aa  206  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  32.81 
 
 		 1082 aa  205  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  31.65 
 
 		 1100 aa  205  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 1105 aa  205  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  33.4 
 
 		 1082 aa  205  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.36 
 
 		 1134 aa  204  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 		 1069 aa  204  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  31.04 
 
 		 1072 aa  204  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 1105 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  30.65 
 
 		 1161 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  31.97 
 
 		 1013 aa  203  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>