More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003242 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  92.95 
 
 		 1146 aa  2225    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  42.83 
 
 		 1010 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  100 
 
 		 1149 aa  2370    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  56.08 
 
 		 1148 aa  1296    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  32.62 
 
 		 1248 aa  312  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  27.26 
 
 		 1131 aa  313  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  32.52 
 
 		 1291 aa  312  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  33.87 
 
 		 1259 aa  303  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  36.86 
 
 		 1075 aa  298  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1128 aa  277  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  34.64 
 
 		 1080 aa  271  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 1082 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 1033 aa  218  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 918 aa  213  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 918 aa  201  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  28.76 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  29.92 
 
 		 918 aa  201  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.55 
 
 		 918 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  28.57 
 
 		 918 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  28.57 
 
 		 918 aa  199  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  28.57 
 
 		 918 aa  199  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  28.57 
 
 		 918 aa  199  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  28.57 
 
 		 918 aa  199  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  28.15 
 
 		 918 aa  199  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 933 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 1074 aa  195  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 898 aa  195  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  32.28 
 
 		 902 aa  195  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 1028 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 1082 aa  194  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  29.94 
 
 		 1048 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  30.88 
 
 		 917 aa  192  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 1112 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 892 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  30.57 
 
 		 1185 aa  190  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  28.63 
 
 		 924 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 1050 aa  188  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  31.16 
 
 		 1047 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 925 aa  188  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 1047 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 1007 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  30.83 
 
 		 1072 aa  187  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1152 aa  185  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  30.56 
 
 		 1065 aa  186  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  31.39 
 
 		 899 aa  186  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.23 
 
 		 1067 aa  185  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  30.68 
 
 		 1019 aa  184  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  28.92 
 
 		 990 aa  184  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  28.92 
 
 		 886 aa  183  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28.4 
 
 		 621 aa  183  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 1048 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  30.5 
 
 		 1063 aa  181  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  29.27 
 
 		 1078 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  29.82 
 
 		 1040 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 633 aa  179  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  28.77 
 
 		 1175 aa  178  6e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  30.43 
 
 		 1019 aa  178  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  29.52 
 
 		 1077 aa  178  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  28.4 
 
 		 1087 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 1021 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.25 
 
 		 1099 aa  177  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 		 1139 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.62 
 
 		 1026 aa  176  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 931 aa  176  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 1069 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 		 1029 aa  174  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  30.52 
 
 		 1531 aa  174  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  28.94 
 
 		 1071 aa  174  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  27.95 
 
 		 1125 aa  174  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  29.54 
 
 		 1006 aa  174  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  28.49 
 
 		 1068 aa  173  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  30.18 
 
 		 918 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.12 
 
 		 914 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  30.3 
 
 		 901 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 617 aa  172  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  30.89 
 
 		 949 aa  171  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 1055 aa  171  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 876 aa  171  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  29.94 
 
 		 1033 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  29.52 
 
 		 1080 aa  169  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 1155 aa  169  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  29.96 
 
 		 1362 aa  168  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  27.83 
 
 		 1069 aa  168  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 1069 aa  168  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 895 aa  168  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  28.16 
 
 		 1031 aa  168  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  28.79 
 
 		 891 aa  168  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  28.18 
 
 		 980 aa  167  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  29 
 
 		 1013 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  28.54 
 
 		 985 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 1068 aa  167  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  28.09 
 
 		 964 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 1068 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  29.96 
 
 		 1386 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.96 
 
 		 1150 aa  166  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  29.11 
 
 		 1250 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  28.11 
 
 		 1354 aa  164  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  28.69 
 
 		 1194 aa  164  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  30.77 
 
 		 777 aa  164  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  28.1 
 
 		 1069 aa  164  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>