More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4753 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 633 aa  1277    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.65 
 
 		 641 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  37.2 
 
 		 1072 aa  303  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 		 1028 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  37.06 
 
 		 1175 aa  299  9e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  35.81 
 
 		 918 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  35.81 
 
 		 918 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.99 
 
 		 1067 aa  297  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 918 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  35.25 
 
 		 918 aa  296  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  36.56 
 
 		 1078 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.26 
 
 		 1087 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  35.61 
 
 		 1006 aa  294  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  36.4 
 
 		 1007 aa  294  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 918 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  35.06 
 
 		 918 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  38.62 
 
 		 621 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  35.06 
 
 		 918 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 		 1021 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 1074 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  34.88 
 
 		 918 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  34.88 
 
 		 918 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  36.16 
 
 		 892 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  34.88 
 
 		 918 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  34.88 
 
 		 918 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 1050 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 		 898 aa  289  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 1091 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.56 
 
 		 1362 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 		 1112 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  34.78 
 
 		 1047 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 1047 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  38.33 
 
 		 1088 aa  287  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 		 1055 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  33.39 
 
 		 1065 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.33 
 
 		 1386 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 		 1007 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  36.59 
 
 		 924 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.46 
 
 		 1071 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  38.65 
 
 		 917 aa  283  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 		 1029 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  39.48 
 
 		 901 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.38 
 
 		 925 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  38.46 
 
 		 985 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  37.76 
 
 		 1013 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  38.29 
 
 		 1019 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  36.7 
 
 		 958 aa  279  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  36.5 
 
 		 988 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  39.52 
 
 		 899 aa  279  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  36.64 
 
 		 1185 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  35.73 
 
 		 1161 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  37.78 
 
 		 991 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  38.24 
 
 		 1194 aa  277  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  37.21 
 
 		 1019 aa  277  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  37.77 
 
 		 1070 aa  276  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 		 1068 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.91 
 
 		 933 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 		 1069 aa  276  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  35.82 
 
 		 914 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 1068 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.63 
 
 		 895 aa  275  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 1112 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  38.82 
 
 		 1091 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  37.33 
 
 		 886 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  38.16 
 
 		 1120 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.68 
 
 		 1139 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  36.02 
 
 		 1108 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 		 1082 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  37.5 
 
 		 1031 aa  273  6e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  35.45 
 
 		 918 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.03 
 
 		 1113 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  37.03 
 
 		 1113 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.59 
 
 		 1125 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  32.99 
 
 		 1063 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  35.62 
 
 		 980 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.16 
 
 		 1068 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  36.48 
 
 		 1068 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 		 1152 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.62 
 
 		 1099 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  37.15 
 
 		 1082 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  37.28 
 
 		 1082 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  37.28 
 
 		 1082 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.14 
 
 		 1077 aa  270  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 1104 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  38.07 
 
 		 931 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  34.78 
 
 		 1284 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  36.69 
 
 		 872 aa  270  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 		 982 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.05 
 
 		 1082 aa  270  8e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 1155 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  37.74 
 
 		 1209 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  33.89 
 
 		 1033 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  36.56 
 
 		 949 aa  269  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 1086 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 1048 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  37.53 
 
 		 1142 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  35.07 
 
 		 1178 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  35.39 
 
 		 1150 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.7 
 
 		 977 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  33.85 
 
 		 1069 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>