More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0293 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 641 aa  1322    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  41.65 
 
 		 633 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  38.76 
 
 		 918 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  38.76 
 
 		 918 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.06 
 
 		 918 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  39.38 
 
 		 918 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.6 
 
 		 918 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  39.38 
 
 		 918 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  39.38 
 
 		 918 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  38.63 
 
 		 918 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  38.63 
 
 		 918 aa  297  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 		 918 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 		 918 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 		 898 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37 
 
 		 1386 aa  289  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  36.77 
 
 		 1362 aa  287  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 		 1028 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  39.2 
 
 		 917 aa  287  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 		 933 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  40.6 
 
 		 901 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 		 925 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  36.88 
 
 		 777 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  37.42 
 
 		 924 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 		 1112 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  38.03 
 
 		 1354 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  36.78 
 
 		 1072 aa  279  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  39.55 
 
 		 1074 aa  278  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  36.84 
 
 		 1006 aa  277  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.56 
 
 		 1029 aa  276  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 		 1050 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 		 1091 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  36.36 
 
 		 1142 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  36.94 
 
 		 1175 aa  273  7e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  39.01 
 
 		 621 aa  273  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  35.36 
 
 		 1178 aa  272  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 		 1069 aa  271  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  36.36 
 
 		 1088 aa  271  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  37.19 
 
 		 1070 aa  271  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  36.73 
 
 		 1007 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  37.39 
 
 		 1087 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.79 
 
 		 1067 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 1403 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 1021 aa  270  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 980 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 		 895 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  34.89 
 
 		 1284 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.98 
 
 		 1026 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  31.94 
 
 		 1048 aa  267  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  36.09 
 
 		 1194 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  35.12 
 
 		 1055 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.67 
 
 		 1071 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  38.48 
 
 		 985 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.11 
 
 		 1068 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  33.76 
 
 		 990 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 1048 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  37.25 
 
 		 1047 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  35.79 
 
 		 1078 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  35.85 
 
 		 1019 aa  264  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  37.37 
 
 		 1209 aa  264  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 1047 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  35.67 
 
 		 1134 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 1113 aa  262  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.63 
 
 		 1068 aa  263  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  34.62 
 
 		 1113 aa  262  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  33.75 
 
 		 1161 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.58 
 
 		 1069 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  34.58 
 
 		 991 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  35.67 
 
 		 958 aa  261  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  34.16 
 
 		 902 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  35.91 
 
 		 1120 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  36.73 
 
 		 1082 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  36.73 
 
 		 1082 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  36.29 
 
 		 903 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  36.38 
 
 		 1130 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  35.09 
 
 		 886 aa  260  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 		 1104 aa  259  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  35.02 
 
 		 1033 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 1152 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  35.91 
 
 		 1120 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  37.92 
 
 		 1040 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.74 
 
 		 1080 aa  259  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  36.44 
 
 		 1185 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  35.87 
 
 		 1531 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  36.52 
 
 		 1082 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 		 1120 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 		 617 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  36.24 
 
 		 1357 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.7 
 
 		 1084 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 		 1007 aa  256  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  34.98 
 
 		 1150 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  36.5 
 
 		 1070 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  36.25 
 
 		 1437 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 		 982 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.17 
 
 		 1069 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  34.71 
 
 		 988 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  38.13 
 
 		 899 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  35 
 
 		 1065 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  31.7 
 
 		 1084 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 1110 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 		 1068 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>