52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3913 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  100 
 
 		 249 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  63.67 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  63.67 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  63.27 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  56.45 
 
 		 247 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  58.63 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  39.29 
 
 		 145 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  41.18 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  48.96 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  41.18 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  39.58 
 
 		 520 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  36.21 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  38.84 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  34.65 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  41.67 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  41.67 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  33.33 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  40.74 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  39.6 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  41.24 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  38.89 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  35.79 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  27.52 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  38.68 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  30.21 
 
 		 333 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.64 
 
 		 349 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  34.62 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.06 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  33.02 
 
 		 493 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  34.23 
 
 		 368 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  29 
 
 		 154 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  29.29 
 
 		 154 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.69 
 
 		 125 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  29.29 
 
 		 154 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  31.76 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  42.11 
 
 		 364 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 144 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.77 
 
 		 440 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.69 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  44.44 
 
 		 1131 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  28.83 
 
 		 1248 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  36.11 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.31 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  27 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  26.85 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  38.37 
 
 		 558 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  32.81 
 
 		 347 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  34.43 
 
 		 1291 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>