162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04060 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  41.47 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  41.97 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  42.55 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  41.86 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  45.21 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  39.52 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  39.31 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  45.09 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  39.39 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  40.34 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  34.63 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  28.65 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  32.95 
 
 		 440 aa  92.4  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.14 
 
 		 327 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  35 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  38.98 
 
 		 421 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  31.46 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  37.5 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  32.38 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  36.61 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  34.58 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 799 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 799 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.43 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.43 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  36.21 
 
 		 585 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  37.29 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  27.1 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  31.01 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  60 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  35.4 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  27.52 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  49.09 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  25.58 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.02 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30.81 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  34.58 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  36.64 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  30.11 
 
 		 192 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  30.43 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  25 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  33.03 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  35.96 
 
 		 421 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  35.85 
 
 		 453 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  26.36 
 
 		 447 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  30.08 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  35.2 
 
 		 455 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  46.81 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  54.29 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  28.45 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  47.73 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5185  restriction endonuclease  34.58 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  25.68 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  58.82 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.62 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  41.67 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  55 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  44.68 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  29.36 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  52.17 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 454 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.16 
 
 		 454 aa  48.9  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  52.5 
 
 		 671 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  35.09 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3538  hypothetical protein  24.85 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  47.73 
 
 		 765 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  30.63 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  52.5 
 
 		 671 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  51.35 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  52.5 
 
 		 671 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  30.93 
 
 		 403 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.63 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  31.73 
 
 		 454 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  30.08 
 
 		 400 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  27.9 
 
 		 493 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  27.12 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  47.06 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  42.55 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  28.46 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  53.85 
 
 		 655 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 219 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 454 aa  46.2  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  37.4 
 
 		 208 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0084  restriction endonuclease  28.16 
 
 		 196 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>