201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1797 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  100 
 
 		 355 aa  734    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  55.91 
 
 		 262 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  50 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  46.32 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  47.21 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  45.54 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  44.37 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  49.29 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  47.16 
 
 		 230 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  43.22 
 
 		 281 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  39.52 
 
 		 285 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  40.78 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.27 
 
 		 252 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  35.26 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  35.52 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.15 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  40.77 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.29 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.29 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  43.88 
 
 		 154 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  26.27 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3538  hypothetical protein  30.29 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  32.5 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  38.98 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  38.98 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  38.54 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  31.85 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.43 
 
 		 154 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.43 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.43 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  32.54 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  34.45 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  56.52 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  34.18 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  51.22 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  55 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  51.22 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  57.5 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  47.83 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  63.16 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30.1 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  36.27 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  41.38 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  35.07 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  28.15 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  32.28 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  29.84 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  31.54 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  26.67 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  52.27 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  32.98 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2804  restriction endonuclease  28.03 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  25.84 
 
 		 182 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0084  restriction endonuclease  24.16 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  32.26 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.76 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  37.33 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  40.74 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3481  restriction endonuclease  28.03 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  28.81 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  52.78 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00723  hypothetical protein  31.25 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  44.64 
 
 		 255 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  39.39 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  34.07 
 
 		 694 aa  53.5  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  29.8 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 704 aa  52.8  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 200 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2469  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  34.74 
 
 		 190 aa  52.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  31 
 
 		 689 aa  52.8  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  29.69 
 
 		 1291 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 455 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  52.63 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3579  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  35.87 
 
 		 180 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0127763  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  31.37 
 
 		 744 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08201  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 		 734 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  30.91 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  32.46 
 
 		 686 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  46.34 
 
 		 671 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  28.38 
 
 		 493 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3766  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  37.08 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000848781  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  36.46 
 
 		 702 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00387  DNA topoisomerase A  30.56 
 
 		 188 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03134  predicted DNA topoisomerase  34.38 
 
 		 180 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0430  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.38 
 
 		 180 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00343806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4606  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  34.38 
 
 		 180 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00790504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03085  hypothetical protein  34.38 
 
 		 180 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0430  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  34.38 
 
 		 180 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00156622  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3477  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  34.38 
 
 		 180 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000183076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3770  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  36.36 
 
 		 180 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  46.34 
 
 		 671 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3672  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  36.36 
 
 		 180 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3707  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  36.36 
 
 		 180 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281277  normal  0.131734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3599  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  36.36 
 
 		 180 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000119283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>