22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3481 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3481  restriction endonuclease  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2804  restriction endonuclease  98.41 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  65.26 
 
 		 222 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1845  restriction endonuclease  50.54 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0084  restriction endonuclease  45.64 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  29.35 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  25.91 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.41 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  26.96 
 
 		 287 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.54 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  30.36 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.09 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  27.93 
 
 		 281 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  29.36 
 
 		 310 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  27.68 
 
 		 289 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  26.45 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 327 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  29.46 
 
 		 440 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  29.25 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  33.93 
 
 		 317 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  28.45 
 
 		 348 aa  41.6  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>