19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1845 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1845  restriction endonuclease  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  51.05 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  46.52 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2804  restriction endonuclease  50.88 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3481  restriction endonuclease  50.88 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0084  restriction endonuclease  42.47 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  25.51 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  24.23 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  30.5 
 
 		 287 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  26.99 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  24.42 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  24.78 
 
 		 355 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  32.38 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  29.73 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  29.09 
 
 		 281 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  22.73 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  26.83 
 
 		 327 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  22.73 
 
 		 154 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>