98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0116 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  55.91 
 
 		 355 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  45.31 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  42.7 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  44.44 
 
 		 289 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  47.6 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  39.39 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  42.75 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  39.9 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  47.31 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  35.71 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.63 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  32.95 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  37.29 
 
 		 421 aa  82  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  30.15 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  47.62 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  32.54 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  35.09 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  31.15 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.97 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  33.08 
 
 		 171 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.46 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  28.46 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.46 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  27.56 
 
 		 799 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  27.56 
 
 		 799 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.54 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  29.06 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  34.21 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  30.15 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  35.38 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  30.43 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00723  hypothetical protein  29.82 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.346466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  29.37 
 
 		 447 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  31.53 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.93 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.93 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30.36 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  31.3 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  26.54 
 
 		 493 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  27.11 
 
 		 346 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0084  restriction endonuclease  23.53 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  28.26 
 
 		 182 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  26.19 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 421 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0356  hypothetical protein  29.57 
 
 		 161 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000881687  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2804  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 189 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  34.69 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3481  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 189 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  30.7 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  25.78 
 
 		 184 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  29.59 
 
 		 386 aa  48.9  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1845  restriction endonuclease  26.99 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  30.08 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  30 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  29.13 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  28.57 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  30.17 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  28.93 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  24.7 
 
 		 454 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  27.7 
 
 		 368 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  31 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  25 
 
 		 454 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  25.76 
 
 		 454 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  27.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  30.21 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  37.68 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3538  hypothetical protein  29.73 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  37.68 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  28.1 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  29.57 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  37.68 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  25.93 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.17 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.42 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  26.62 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  26.77 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  26.77 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  26.77 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  26.61 
 
 		 128 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 403 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  24.1 
 
 		 454 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 178 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  27.73 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  25.27 
 
 		 1291 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  25.9 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 312 aa  42.4  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  30 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>