20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3831 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  100 
 
 		 222 aa  430  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2804  restriction endonuclease  65.5 
 
 		 189 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3481  restriction endonuclease  64.33 
 
 		 189 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1845  restriction endonuclease  51.05 
 
 		 190 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1543  hypothetical protein  46.11 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0084  restriction endonuclease  46.56 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.85 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  28.5 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  32.54 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  36.44 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.87 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  32.05 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  31.58 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  33.03 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  37.66 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  31.61 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  30.84 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30.5 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  39.06 
 
 		 272 aa  41.6  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  28.23 
 
 		 314 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>