64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0538 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  100 
 
 		 314 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  56.77 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  56.77 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  37.38 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  38.46 
 
 		 440 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  31.16 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  34.26 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3538  hypothetical protein  35.16 
 
 		 276 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  27.1 
 
 		 252 aa  96.7  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  28.91 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  29.36 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  25.79 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  26.9 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.64 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  30.56 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  30.48 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  32.5 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  36.94 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  28.99 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  30.52 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  27.52 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  31.06 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.15 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  30.73 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  26.04 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  25.71 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  30.85 
 
 		 403 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  25.44 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  26.62 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  27.59 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  25.83 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  24.31 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  24.56 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  27.55 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  23.02 
 
 		 154 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  32 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  25.21 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  30.3 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  23.02 
 
 		 154 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  22.66 
 
 		 125 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  20.13 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  23.02 
 
 		 154 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  29.03 
 
 		 400 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  31.96 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  46.34 
 
 		 971 aa  45.8  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.5 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  21.9 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  25 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  30.5 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  26.71 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  26.49 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  25.6 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  57.69 
 
 		 1042 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  26.75 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  26.75 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  26.75 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  28.26 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  25.83 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  29.67 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  25.68 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  39.39 
 
 		 1131 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>