104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0488 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  100 
 
 		 317 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  40.27 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  40.27 
 
 		 440 aa  225  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  37.38 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  44.85 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.5 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.5 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  35.37 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  36.56 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 252 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  35.52 
 
 		 355 aa  99.4  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  33.18 
 
 		 271 aa  99  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  34.92 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  35 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3538  hypothetical protein  30.29 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  33.52 
 
 		 230 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  31.07 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  28.53 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.63 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  27.2 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33.66 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  32.84 
 
 		 421 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  30.25 
 
 		 585 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  39.45 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  30 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  25.62 
 
 		 154 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  25.62 
 
 		 154 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  25.62 
 
 		 154 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  25.62 
 
 		 125 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  28.47 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  27.8 
 
 		 799 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  27.8 
 
 		 799 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  28.04 
 
 		 182 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  28.91 
 
 		 200 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.23 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  26.03 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  28.57 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  29.25 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  51.52 
 
 		 671 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  33 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  51.52 
 
 		 671 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  51.52 
 
 		 670 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  26.87 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  33.58 
 
 		 1004 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  57.14 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  39.58 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  27.1 
 
 		 182 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 671 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  42.86 
 
 		 673 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.31 
 
 		 493 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  35.09 
 
 		 669 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  39.47 
 
 		 817 aa  46.2  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  27.5 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 695 aa  46.2  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  36.21 
 
 		 655 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 670 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 671 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3510  restriction endonuclease  25.69 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 676 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  51.43 
 
 		 799 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 670 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  28.3 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 676 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  35.59 
 
 		 690 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 670 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  32.79 
 
 		 693 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  23.85 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  29.51 
 
 		 684 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  25.29 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 670 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  40.54 
 
 		 812 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  40.54 
 
 		 814 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  40.54 
 
 		 814 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  46.88 
 
 		 666 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  25.76 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  46.88 
 
 		 654 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  36.84 
 
 		 700 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  35.29 
 
 		 894 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  38.24 
 
 		 696 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  36.84 
 
 		 700 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  51.61 
 
 		 1041 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  36.84 
 
 		 700 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  46.88 
 
 		 655 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 768 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  30.48 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3831  restriction endonuclease  29.38 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.504665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  29.63 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 689 aa  43.1  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  26.36 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  22.22 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  37.84 
 
 		 694 aa  43.1  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  30.48 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>