64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0292 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  38.51 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  44.96 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  32.91 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  40.46 
 
 		 174 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  24.6 
 
 		 220 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01628  hypothetical protein  31.77 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  31.21 
 
 		 201 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  24.49 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4785  hypothetical protein  28 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00673705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  26.51 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  34.53 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1551  hypothetical protein  28.29 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  28.82 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  30.73 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  30.17 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  25.58 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  48.98 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  33.7 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  43.86 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  62.16 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  52.63 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  29.2 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  30.47 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  27.43 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  53.85 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  50 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  38.78 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  44.64 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  31.37 
 
 		 182 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  54.05 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  31.37 
 
 		 182 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  40.43 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  47.37 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  63.64 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  27.91 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  50 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  36.73 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  56.76 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  52.63 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  51.43 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  42.55 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  26.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2102  hypothetical protein  28.81 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.38 
 
 		 739 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  45.95 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2298  hypothetical protein  28.81 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  38.3 
 
 		 744 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  42.22 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  27.2 
 
 		 188 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  42.11 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  45.65 
 
 		 722 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  41.3 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  27.15 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  35.71 
 
 		 655 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  45.71 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08201  DNA topoisomerase III  46.88 
 
 		 734 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0178997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  41.67 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  38.46 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 706 aa  42  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>