13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4785 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4785  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00673705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01628  hypothetical protein  45.34 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  45.68 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  34.03 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  31.46 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  28 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  30.53 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.45 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1551  hypothetical protein  25.81 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  31.21 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  21.62 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  22.56 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  22.22 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>