13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0540 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01628  hypothetical protein  57.44 
 
 		 195 aa  230  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4785  hypothetical protein  45.68 
 
 		 227 aa  151  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00673705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  28.93 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  31.21 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.83 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  27.2 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1551  hypothetical protein  27.82 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  24.32 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  23.24 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  24.38 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  25.74 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>