18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003451 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  453  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  34.53 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  35.25 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  35.06 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  32.5 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  29.91 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  33.03 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  36.11 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  30.94 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  34.29 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  31.78 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  33.64 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  32.58 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2102  hypothetical protein  29.91 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  30.69 
 
 		 182 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  25.74 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  25.81 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>