17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5157 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  343  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  46.15 
 
 		 234 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2853  putative signal peptide  38.26 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  31.67 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  27.91 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  36.11 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  31.97 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  27.43 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  36.59 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  27.43 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  22.44 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  28.09 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  31.86 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6906  hypothetical protein  24.39 
 
 		 285 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0844727  normal  0.78542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3221  hypothetical protein  29.63 
 
 		 267 aa  40.8  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.34807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>