17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6063 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  46.15 
 
 
169 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  35.87 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  28.93 
 
 
176 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  28.93 
 
 
176 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  29.46 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  30.47 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  31.19 
 
 
160 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4770  hypothetical protein  31.78 
 
 
282 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2853  putative signal peptide  35.19 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  28.97 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  34.29 
 
 
219 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  30.4 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1922  hypothetical protein  29.46 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  34.34 
 
 
174 aa  42.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>