31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1077 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  343  8.999999999999999e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  42.96 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  38.85 
 
 		 255 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  35.37 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  40.17 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01628  hypothetical protein  29.03 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4785  hypothetical protein  28.48 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00673705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  43.96 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  32.5 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1551  hypothetical protein  31.78 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  30.52 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  23.49 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  23.75 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  30.72 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  29.63 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  34.55 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  31.93 
 
 		 196 aa  51.2  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  31.09 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  25.2 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5086  hypothetical protein  47.17 
 
 		 316 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000190539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  34.43 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  40.68 
 
 		 928 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  31.85 
 
 		 234 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  31.86 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  26.19 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  26.19 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0159  hypothetical protein  37.68 
 
 		 845 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  31.51 
 
 		 916 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  34.91 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>