26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0472 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  93.18 
 
 
176 aa  342  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  71.63 
 
 
174 aa  217  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  35.88 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  35.11 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  36.89 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  30.84 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  30.17 
 
 
255 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  29.92 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1801  hypothetical protein  24.6 
 
 
237 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  28.93 
 
 
234 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0553  hypothetical protein  27.14 
 
 
269 aa  55.1  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  32.71 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  29.63 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3221  hypothetical protein  26.52 
 
 
267 aa  50.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  29.46 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  27.68 
 
 
196 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  33.64 
 
 
219 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  27.43 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  29.31 
 
 
188 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  33.72 
 
 
100 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  30.19 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  28 
 
 
219 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  27.93 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2102  hypothetical protein  30.19 
 
 
228 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>