29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1837 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  355  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  62.21 
 
 		 176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  71.63 
 
 		 176 aa  217  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  27.17 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  30.95 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  28.82 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  27.92 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3221  hypothetical protein  26.95 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  29.46 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  31.67 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  29.46 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  45.16 
 
 		 206 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  27.2 
 
 		 219 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  27.15 
 
 		 229 aa  50.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  30.36 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  30.33 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0553  hypothetical protein  22.15 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  31.9 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  29.73 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2298  hypothetical protein  29.06 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2102  hypothetical protein  29.06 
 
 		 228 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  25.21 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  24.83 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1801  hypothetical protein  21.64 
 
 		 237 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  34.57 
 
 		 904 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  30 
 
 		 925 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>