20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_C0029 on replicon NC_009787
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  55.86 
 
 		 196 aa  154  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  54.48 
 
 		 196 aa  151  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  35.78 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  35.78 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  34.93 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  35.51 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0086  w0003  50.82 
 
 		 112 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  38.1 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  32.06 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  30.33 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  31.97 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  30.17 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  27.2 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  29.31 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  29.82 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  29.82 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  30.86 
 
 		 100 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  28.81 
 
 		 176 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>