25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1058 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  98.35 
 
 		 182 aa  364  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  30.64 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  31.4 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  30.99 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3221  hypothetical protein  29.28 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0553  hypothetical protein  29.29 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2853  putative signal peptide  28.65 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  28.26 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0375  hypothetical protein  28.36 
 
 		 275 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  32.81 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  30.71 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  25 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  29.92 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  29.71 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1801  hypothetical protein  21.8 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  30.68 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3159  hypothetical protein  24.68 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111438 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  31.82 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  33.72 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  29.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  26.98 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  26.36 
 
 		 229 aa  42  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4251  hypothetical protein  32.31 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00586984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>