15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0553 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3159  hypothetical protein  46.05 
 
 		 239 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2723  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1801  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1520  hypothetical protein  31.45 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1364  hypothetical protein  26.8 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  hitchhiker  0.00420944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2055  hypothetical protein  28.47 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  28.99 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  28.99 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3221  hypothetical protein  29.32 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  26.9 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  26.9 
 
 		 176 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0375  hypothetical protein  24.29 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  25.95 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>