77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2432 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  32.91 
 
 		 255 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  42.96 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  27.55 
 
 		 229 aa  98.6  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  32.31 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  40.58 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  30.77 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  28.83 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  32.2 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01628  hypothetical protein  28.23 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4785  hypothetical protein  31.45 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00673705  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  51.19 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  29.91 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  32.71 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  31.33 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  41.94 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 743 aa  51.6  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  38.1 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  45.16 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 765 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  29.92 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  42.55 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  34.04 
 
 		 928 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1487  hypothetical protein  34.12 
 
 		 250 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0197045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  29.92 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  31.75 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  40.43 
 
 		 702 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6614  DNA topoisomerase III  39.68 
 
 		 687 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  29.57 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6523  DNA topoisomerase III  39.68 
 
 		 687 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.728561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  66.67 
 
 		 971 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  26.6 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  35.29 
 
 		 925 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  36.59 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  26.04 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 694 aa  45.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2078  hypothetical protein  35.29 
 
 		 251 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  32.84 
 
 		 693 aa  45.1  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4319  DNA topoisomerase III  38.1 
 
 		 687 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.535821  normal  0.574882 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  53.57 
 
 		 689 aa  45.1  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  60 
 
 		 859 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  32.61 
 
 		 747 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  56.67 
 
 		 836 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  33.33 
 
 		 780 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 995 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0023  DNA topoisomerase III  34.09 
 
 		 679 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  48.39 
 
 		 814 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1551  hypothetical protein  25.6 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  55.56 
 
 		 704 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  48.39 
 
 		 814 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  46.88 
 
 		 671 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  48.39 
 
 		 812 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  46.88 
 
 		 671 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2218  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  36.59 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  26.25 
 
 		 853 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  53.57 
 
 		 715 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  42.42 
 
 		 817 aa  42.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  48.65 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 914 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4251  hypothetical protein  36.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00586984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 911 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  43.48 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3908  hypothetical protein  33.64 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  40.91 
 
 		 853 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 260 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  29.61 
 
 		 249 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 911 aa  42  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  45.45 
 
 		 696 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  48.39 
 
 		 317 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  39.02 
 
 		 768 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 911 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  41.03 
 
 		 256 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  51.85 
 
 		 694 aa  41.2  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  44.12 
 
 		 798 aa  41.2  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>