More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0203 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  66.62 
 
 		 853 aa  1096    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 814 aa  1658    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  82.41 
 
 		 817 aa  1394    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  95.18 
 
 		 812 aa  1511    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  96.12 
 
 		 814 aa  1498    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  33.64 
 
 		 747 aa  364  5.0000000000000005e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  35.37 
 
 		 771 aa  351  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  32.2 
 
 		 702 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  34.46 
 
 		 743 aa  343  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  31.32 
 
 		 849 aa  343  5.999999999999999e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  31.41 
 
 		 837 aa  343  7e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.4 
 
 		 837 aa  340  5.9999999999999996e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  29.58 
 
 		 834 aa  335  2e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  30.72 
 
 		 844 aa  332  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  29.43 
 
 		 863 aa  331  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  34.09 
 
 		 744 aa  330  7e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  30.48 
 
 		 843 aa  327  8.000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  33.82 
 
 		 668 aa  317  4e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  30.96 
 
 		 827 aa  317  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  31.49 
 
 		 931 aa  303  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.76 
 
 		 864 aa  300  6e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  30.58 
 
 		 942 aa  300  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.87 
 
 		 938 aa  300  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  31.71 
 
 		 931 aa  293  6e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  31.53 
 
 		 935 aa  281  5e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  28.03 
 
 		 780 aa  273  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  27.15 
 
 		 855 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  31.06 
 
 		 765 aa  261  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  31.06 
 
 		 765 aa  259  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 689 aa  253  8.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 		 768 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  29.37 
 
 		 702 aa  251  3e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  28.95 
 
 		 704 aa  250  9e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 693 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.29 
 
 		 694 aa  249  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 695 aa  248  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 870 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 789 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 869 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 841 aa  244  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  30.34 
 
 		 868 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 759 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 759 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  30.21 
 
 		 868 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  28.4 
 
 		 853 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 743 aa  241  4e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  29.3 
 
 		 865 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.36 
 
 		 868 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 869 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  29.52 
 
 		 868 aa  240  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 869 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 869 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  27.19 
 
 		 851 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  27.19 
 
 		 851 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 793 aa  238  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 876 aa  237  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  26.87 
 
 		 802 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  30.21 
 
 		 693 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  26.69 
 
 		 696 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.51 
 
 		 869 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 700 aa  235  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  27.83 
 
 		 892 aa  234  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 684 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  26.51 
 
 		 836 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 700 aa  232  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 894 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  27.34 
 
 		 780 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 758 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 804 aa  230  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 876 aa  230  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 700 aa  230  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 894 aa  230  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  30.62 
 
 		 879 aa  230  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  28.07 
 
 		 865 aa  230  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  28.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 894 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 865 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 865 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  30.78 
 
 		 697 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  27.98 
 
 		 896 aa  229  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 		 865 aa  229  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  28.52 
 
 		 886 aa  228  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  29.64 
 
 		 702 aa  228  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 		 878 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  28.3 
 
 		 865 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 700 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  28.3 
 
 		 865 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  28.3 
 
 		 865 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  28.3 
 
 		 865 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  28.3 
 
 		 865 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 867 aa  226  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  25.34 
 
 		 760 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 868 aa  226  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 756 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  27.04 
 
 		 798 aa  226  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>