More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2410 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  44.62 
 
 		 863 aa  642    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  46.34 
 
 		 935 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  47.79 
 
 		 844 aa  647    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 771 aa  1592    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  46.37 
 
 		 931 aa  670    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  67.21 
 
 		 743 aa  1065    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  45.54 
 
 		 931 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  55.81 
 
 		 744 aa  879    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  46.08 
 
 		 938 aa  653    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  43.83 
 
 		 942 aa  633  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  45.26 
 
 		 843 aa  627  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  46.4 
 
 		 827 aa  624  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  46.38 
 
 		 702 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  44.88 
 
 		 864 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  41.72 
 
 		 849 aa  543  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  40.92 
 
 		 837 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  40.11 
 
 		 834 aa  515  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  43.48 
 
 		 747 aa  512  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  40.44 
 
 		 837 aa  503  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  32.44 
 
 		 855 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  31.31 
 
 		 780 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  36.19 
 
 		 814 aa  363  9e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  36.14 
 
 		 812 aa  359  9e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  35.45 
 
 		 814 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  34.51 
 
 		 817 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  32.44 
 
 		 853 aa  332  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.45 
 
 		 604 aa  300  5e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  32.75 
 
 		 631 aa  294  4e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.69 
 
 		 602 aa  290  6e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.13 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.44 
 
 		 610 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  31.56 
 
 		 596 aa  264  4e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  30.37 
 
 		 668 aa  251  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  30.79 
 
 		 694 aa  226  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  30.08 
 
 		 695 aa  225  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  28.34 
 
 		 863 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 691 aa  224  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  28.86 
 
 		 616 aa  221  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  28.91 
 
 		 693 aa  220  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  30.12 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  29.76 
 
 		 693 aa  219  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 869 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 869 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 869 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 700 aa  218  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 868 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 868 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  27.51 
 
 		 669 aa  216  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 708 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.36 
 
 		 868 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.27 
 
 		 700 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  29.72 
 
 		 702 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  25.78 
 
 		 868 aa  214  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  28.13 
 
 		 869 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 693 aa  214  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  27.16 
 
 		 758 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.99 
 
 		 751 aa  213  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.84 
 
 		 876 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 700 aa  211  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  29.84 
 
 		 746 aa  211  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 691 aa  210  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 691 aa  210  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 691 aa  207  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  25.85 
 
 		 828 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 868 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  29.45 
 
 		 876 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 700 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 		 700 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  27.41 
 
 		 629 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 689 aa  205  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  29.54 
 
 		 718 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  27.79 
 
 		 696 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  27.22 
 
 		 859 aa  204  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.5 
 
 		 760 aa  204  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  27.48 
 
 		 870 aa  203  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  27.96 
 
 		 690 aa  203  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  28.96 
 
 		 714 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 867 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  29.58 
 
 		 684 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  29.52 
 
 		 694 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  27.1 
 
 		 702 aa  202  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 869 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  27.74 
 
 		 696 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 865 aa  201  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 865 aa  201  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  28.81 
 
 		 865 aa  201  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 865 aa  201  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 865 aa  201  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 704 aa  200  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 865 aa  200  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 865 aa  200  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  25.9 
 
 		 747 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 865 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 866 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  27.98 
 
 		 696 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 		 868 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  27.54 
 
 		 694 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  27.77 
 
 		 695 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 872 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>