More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1299 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  46.08 
 
 		 771 aa  635    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  59.05 
 
 		 931 aa  1144    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  63.2 
 
 		 931 aa  1218    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  100 
 
 		 938 aa  1937    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  54.22 
 
 		 935 aa  1002    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  62.43 
 
 		 942 aa  1205    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  47.44 
 
 		 744 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  45.86 
 
 		 743 aa  634  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  45.83 
 
 		 863 aa  585  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  45.53 
 
 		 844 aa  581  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  45.31 
 
 		 843 aa  571  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  45.35 
 
 		 827 aa  551  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  42.59 
 
 		 864 aa  547  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  44.51 
 
 		 702 aa  529  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  42.04 
 
 		 747 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.4 
 
 		 849 aa  472  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  39.07 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.21 
 
 		 837 aa  460  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  37.65 
 
 		 837 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  29.8 
 
 		 780 aa  317  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.38 
 
 		 855 aa  303  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  31.17 
 
 		 817 aa  302  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  32.87 
 
 		 814 aa  300  8e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  32.87 
 
 		 814 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  32.39 
 
 		 812 aa  291  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  30.45 
 
 		 853 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.67 
 
 		 610 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  34.4 
 
 		 602 aa  270  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  31.65 
 
 		 604 aa  267  5e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.66 
 
 		 604 aa  262  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  31.32 
 
 		 631 aa  261  4e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32.72 
 
 		 596 aa  259  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 668 aa  252  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  29.73 
 
 		 863 aa  222  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  29.4 
 
 		 616 aa  221  7e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 689 aa  216  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  28.64 
 
 		 828 aa  210  8e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  29.47 
 
 		 629 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  27.97 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  27.18 
 
 		 691 aa  207  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  30.22 
 
 		 768 aa  205  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  28.41 
 
 		 768 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  31.74 
 
 		 719 aa  202  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  30.86 
 
 		 857 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  27.98 
 
 		 669 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  27.74 
 
 		 694 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  27.36 
 
 		 684 aa  201  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 		 743 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 695 aa  200  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  26.96 
 
 		 690 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 700 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  29.35 
 
 		 867 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  27.05 
 
 		 695 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  29.85 
 
 		 789 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 866 aa  196  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 700 aa  195  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 793 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.02 
 
 		 700 aa  195  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 845 aa  195  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1923  DNA topoisomerase I  29.29 
 
 		 871 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0924763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2033  DNA topoisomerase I  29.29 
 
 		 871 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 868 aa  194  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 868 aa  194  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  30.53 
 
 		 859 aa  193  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2304  DNA topoisomerase I  29.26 
 
 		 871 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.926517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  29.91 
 
 		 701 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.35 
 
 		 751 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  26.98 
 
 		 693 aa  192  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  27.3 
 
 		 866 aa  191  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 849 aa  191  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  27.5 
 
 		 879 aa  191  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 872 aa  190  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  27.55 
 
 		 675 aa  189  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.75 
 
 		 869 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  28.24 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  27.03 
 
 		 671 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  29.58 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  27.24 
 
 		 694 aa  189  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  26.73 
 
 		 671 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.75 
 
 		 869 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.75 
 
 		 869 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  29.26 
 
 		 898 aa  189  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 865 aa  189  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  26.17 
 
 		 694 aa  188  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  26.57 
 
 		 670 aa  188  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  27.18 
 
 		 696 aa  188  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 880 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 865 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 865 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 865 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 865 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  26.42 
 
 		 671 aa  187  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 865 aa  187  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 868 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>