More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0095 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  47.42 
 
 		 844 aa  635    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  47.92 
 
 		 931 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  48.45 
 
 		 827 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  67.21 
 
 		 771 aa  1055    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  46.95 
 
 		 935 aa  648    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  47.06 
 
 		 931 aa  672    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 743 aa  1536    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  48.55 
 
 		 863 aa  655    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  45.86 
 
 		 938 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  57.03 
 
 		 744 aa  885    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  46.69 
 
 		 843 aa  646    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  42.4 
 
 		 942 aa  626  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  45.94 
 
 		 702 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  45.2 
 
 		 864 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  41.7 
 
 		 849 aa  531  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  41.17 
 
 		 837 aa  531  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  42.54 
 
 		 747 aa  515  1e-144  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.53 
 
 		 837 aa  515  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  40.17 
 
 		 834 aa  511  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  32.51 
 
 		 780 aa  382  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.88 
 
 		 855 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  34.76 
 
 		 812 aa  353  8e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  35.4 
 
 		 814 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  35.2 
 
 		 814 aa  349  9e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  34.07 
 
 		 817 aa  334  3e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 853 aa  332  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.11 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  31.73 
 
 		 631 aa  291  3e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.76 
 
 		 602 aa  280  5e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  30.81 
 
 		 604 aa  280  6e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  30.51 
 
 		 604 aa  276  7e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32 
 
 		 596 aa  261  4e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  32.08 
 
 		 668 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  31.6 
 
 		 743 aa  244  6e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  32.06 
 
 		 689 aa  240  9e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  30.99 
 
 		 684 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 695 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  30.92 
 
 		 700 aa  231  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  30.77 
 
 		 700 aa  230  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  31.06 
 
 		 694 aa  228  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 669 aa  228  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.61 
 
 		 693 aa  227  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  30.62 
 
 		 700 aa  226  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  30.23 
 
 		 694 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  30.34 
 
 		 869 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  30.34 
 
 		 869 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  30.34 
 
 		 869 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  30.92 
 
 		 869 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  30.12 
 
 		 704 aa  220  6e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  26.82 
 
 		 868 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  25.89 
 
 		 863 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  28.18 
 
 		 696 aa  217  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 691 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  28.08 
 
 		 695 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  27.39 
 
 		 629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  29.09 
 
 		 702 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  29.35 
 
 		 756 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  28.59 
 
 		 715 aa  214  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  27.09 
 
 		 691 aa  213  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  27.2 
 
 		 693 aa  213  9e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  27.09 
 
 		 691 aa  213  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 765 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  28.96 
 
 		 853 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  27.07 
 
 		 702 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  28.22 
 
 		 721 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  31.25 
 
 		 868 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.76 
 
 		 868 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  27.49 
 
 		 729 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  30.29 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 700 aa  210  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 841 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  30.1 
 
 		 876 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 700 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 694 aa  210  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 876 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 868 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 690 aa  208  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  26.99 
 
 		 616 aa  207  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 868 aa  208  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 865 aa  207  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 865 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 865 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  29.07 
 
 		 865 aa  207  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 865 aa  207  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 865 aa  207  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 865 aa  207  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  27.67 
 
 		 711 aa  207  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 865 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 759 aa  207  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 708 aa  207  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 865 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 706 aa  207  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 865 aa  207  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 759 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  29.75 
 
 		 865 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  28.51 
 
 		 679 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  29.21 
 
 		 866 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  29.72 
 
 		 746 aa  206  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>