More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34564 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  100 
 
 		 616 aa  1296    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  46.4 
 
 		 629 aa  560  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  46.13 
 
 		 828 aa  528  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  37.29 
 
 		 1009 aa  430  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  34.99 
 
 		 641 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  33.44 
 
 		 868 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  31.8 
 
 		 863 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  31.81 
 
 		 610 aa  274  4.0000000000000004e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32 
 
 		 604 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  32.18 
 
 		 631 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.56 
 
 		 602 aa  258  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.45 
 
 		 855 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 702 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  30.28 
 
 		 942 aa  248  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.3 
 
 		 780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32.66 
 
 		 596 aa  240  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  30.02 
 
 		 604 aa  239  8e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  29.24 
 
 		 747 aa  234  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  28.88 
 
 		 931 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  28.12 
 
 		 931 aa  232  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 744 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  27.21 
 
 		 843 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.4 
 
 		 938 aa  221  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  27.67 
 
 		 935 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 771 aa  217  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  27.74 
 
 		 844 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 827 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  28.15 
 
 		 817 aa  211  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  26.54 
 
 		 863 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  27.4 
 
 		 834 aa  206  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.62 
 
 		 849 aa  204  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  28.86 
 
 		 837 aa  201  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  26.14 
 
 		 853 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 		 743 aa  198  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  26.54 
 
 		 864 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  25.91 
 
 		 814 aa  193  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  25.67 
 
 		 812 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  25.16 
 
 		 837 aa  190  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  25.37 
 
 		 814 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  27.73 
 
 		 731 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  27.73 
 
 		 731 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  27.48 
 
 		 721 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  26.94 
 
 		 697 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  27.07 
 
 		 668 aa  160  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  26.7 
 
 		 718 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  25.73 
 
 		 695 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  26.32 
 
 		 701 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  27.9 
 
 		 744 aa  154  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  25.93 
 
 		 729 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  25.31 
 
 		 669 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  26.35 
 
 		 722 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  25.57 
 
 		 695 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  25.58 
 
 		 700 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  29.38 
 
 		 689 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1013  DNA topoisomerase I, putative  24.28 
 
 		 705 aa  146  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  26.37 
 
 		 869 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  26.37 
 
 		 869 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  26.37 
 
 		 869 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  26.37 
 
 		 869 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  26.37 
 
 		 869 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  26.37 
 
 		 869 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  26.37 
 
 		 906 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  25.48 
 
 		 768 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  25.4 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  25.77 
 
 		 908 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  26.07 
 
 		 876 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 		 852 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  23.67 
 
 		 697 aa  144  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  26.07 
 
 		 697 aa  144  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  25.84 
 
 		 865 aa  144  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  25.84 
 
 		 865 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  25.13 
 
 		 700 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 696 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  24.88 
 
 		 653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  24.43 
 
 		 746 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  25.73 
 
 		 865 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  25.76 
 
 		 891 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  25.99 
 
 		 891 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  25.66 
 
 		 849 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  25.92 
 
 		 876 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  25.12 
 
 		 652 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  23.66 
 
 		 686 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  25 
 
 		 653 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  25.38 
 
 		 865 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  25.38 
 
 		 865 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  25.38 
 
 		 865 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  26.17 
 
 		 754 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  24.6 
 
 		 654 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  26 
 
 		 679 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  26.07 
 
 		 865 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  25.82 
 
 		 680 aa  140  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  27.19 
 
 		 692 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  27.83 
 
 		 670 aa  140  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 692 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 692 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 692 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  27.18 
 
 		 692 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 692 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  23.88 
 
 		 711 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>